故事情节充满了紧张和悬疑。在这个电影中，帝王组织建立了一个观察区，公开了大量与巨兽有关的信息，这包括了之前的魔斯拉、翼龙拉顿、三头龙基多拉和哥斯拉的混战。

与此同时，一个名为APEX的高科技公司试图通过一项危险的任务来消灭哥斯拉。然而，这项任务充满了风险和不确定性。哥斯拉感知到了APEX的机械巨兽，并开始对人类发动攻击。为了获得更多的能源，APEX决定利用金刚去探寻地心世界。

金刚是一只巨大的猩猩，他一直渴望回到自己的家园。在这次冒险中，金刚与他的保护者们一起踏上了一段充满困难的旅程。他们的队伍中还有一个年轻的孤儿女孩，名叫吉雅。吉雅与金刚之间存在着一种特殊而强大的联系，这使得她成为了整个冒险的重要一部分。

然而，他们在前行的道路上与愤怒的哥斯拉相遇，这让情况变得更加危险。同时，他们也逐渐揭开了深藏在地心世界的奥秘。