电影《落难神偷》带领观众穿越时光回到了孤岛时期的上海滩，讲述了一个充满谜团的故事。主人公陆天尧（林雨申饰）看似是法租界里的风华绅士，英俊潇洒，举止优雅，然而，背后却隐藏着一个不为人知的身份，他是一名小偷，经常接受上流社会人士的委托，盗取珍贵之物，并以绝对的保密性为他们保守秘密。

故事的起点是一个神秘的委托，一名不愿透露身份的委托人要求陆天尧前去商人卢弘文家盗取一只红色天鹅绒外皮的盒子。夜幕降临，陆天尧前往卢弘文的高级公寓，顺利地进入了屋内，然而，当他打开书桌抽屉时，眼前的景象令他大吃一惊。委托人所说的小盒子不见了，取而代之的是卢弘文被残忍杀害的现场。更令人震惊的是，就在他心神不宁之际，三名警察突然闯入了房间，将他当作凶手逮捕。

这个盒子不寻常，它涉及一批珍贵药材的去向，成为地下党和日本特务争夺的焦点。陆天尧成为通缉犯，不得不一边躲藏，一边寻找盒子的下落。在这个错综复杂的情节中，观众将跟随主人公一同解开谜团，揭示事件的真相。