电影《秘密1999》讲述了一个超自然的故事，其中涉及了生死、身份、以及家庭的情感纠葛。在一个寒假的旅途中，主人公直子和女儿藻奈美遭遇了一场严重的车祸，导致直子不幸丧生。然而，奇迹发生了，藻奈美虽然幸免于难，但她却表现出了与她母亲直子一模一样的行为和记忆。她准确地重现了她母亲和父亲的初次约会，甚至是两人私密的时刻。这一切让她的父亲平介感到十分困惑，他开始相信这是灵魂附体。

然而，这个情节的反转使得平介陷入了一种困境。他不知道该如何处理这个情况。他既要充当丈夫，也要扮演父亲的角色。直子的灵魂似乎很愿意通过藻奈美的身体来体验一些她曾经错过的东西，甚至包括校园生活和恋爱。这双重身份的复杂性使得平介不得不重新审视自己的生活和家庭。