《午夜妖精》是一部情感丰富的电影，讲述了在东京新宿某个破旧角落生活着一对姐妹的故事。姐姐福井明美经营着名为“郁金香”的小酒吧，兼做着皮肉生意，而情人小泽健次则是酒吧的保镖。明美的妹妹则被称为“金丝雀”，她智商较低，是姐姐酒吧的员工。尽管她生活在泥沼之中，但却依然保持着单纯纯真的本性

某天，一个不速之客闯入了姐妹俩的生活。这个名叫坂口一夫的青年刚刚打劫完一个富豪家，与明美发生口角，最终被小泽暴力驱逐出酒吧。第二天清晨，金丝雀看到坂口受伤的样子，她不顾明美和小泽的反对，决定留下他。他们一起哼唱童谣，找到了彼此的认同感，于是一段奇妙的情缘开始了。

电影通过细腻的情节和感人至深的表现，展现了姐妹之间复杂的情感以及他们与坂口之间的特殊关系。明美在生活中扮演多重角色，是酒吧老板、皮肉生意经营者，也是金丝雀的姐姐和保护者。金丝雀则是那个单纯善良，有着温暖心灵的少女，她对坂口的包容和理解让人感动。