电影《降龙伏虎小济公 第二季》延续了前作的故事，继续讲述了降龙罗汉因为一次意外而不得不进行“借尸还魂”的冒险。在这一季中，降龙罗汉转世为天台县县令洪少余，与伏虎罗汉、神龙元神投胎而成的小修缘一起，共同展开了一系列的冒险故事

故事情节包括了除妖伏魔和护佑百姓的任务。降龙伏虎与小修缘合作，揭开了多年来的冤案之谜，同时也感化了一位一直怀着复仇念头的“古井冤魂”。他们还一起解决了天台县的诡异案件，破解了神秘的“鬼吹灯”之谜，让一对有情人能够团聚。

电影通过一系列的冒险和挑战，展现了降龙伏虎和小修缘的智慧和勇气。他们不仅要面对邪恶势力的威胁，还要解开复杂的谜团，为正义而战。与此同时，影片也探讨了友情、合作和坚持不懈追求真相的主题。