在奎达工厂事件两周后，斯莱塔在学园中期待与米奥莉奈的重逢，同时度过每一天。而米奥莉奈则留在贝纳里特集团本部照顾她的父亲。面对着新的困难和迫在眉睫的抉择，她们将迎来新的挑战。

少女们怀揣着各自的情感，面对着高达所带来的强大诅咒。她们将面临艰难的选择，探索自己内心的勇气和坚定。这是一段关于勇气、爱情和成长的故事，也是关于机动战士高达世界的续篇。

《机动战士高达 水星的魔女 Part 2》将进一步展开故事的篇章，揭示更多秘密和谜团。观众将见证斯莱塔和米奥莉奈的成长，他们的友谊和爱情将在机动战士高达的世界中经历考验与磨砺。