《甜蜜杀手》是一部充满复杂情节的电影，主要讲述了一名在教堂担任修女职务的女性Noel的故事。然而，她的真实身份是神父Logan安排的一名精锐狙击手，她的任务是确保100％击毙指定目标。从小到大，Noel的人生充满了背叛和艰辛，她逐渐成为了最强的女杀手，积累了丰富的杀戮经验

在故事中，Noel遇到了一位名叫井川的男性，他在外表上是企业职员，但身上却透着浓重的黑帮气息。井川在寻找一名失踪的艺妓，这引起了某个组织的不安，于是他们命令Noel接近井川，以便掌握真相。然而，随着对井川的接触，Noel开始产生了前所未有的情感。

随着剧情的发展，井川逐渐接近真相，而组织下令Noel杀死他。然而，面对井川的时候，Noel发现自己陷入了两难的境地。她开始反思自己的使命和感情之间的矛盾，内心陷入挣扎。