电影《万古仙穹 第三季》呈现了大乾王朝与太阳神宫之间即将爆发的巨大战役。在这个紧要关头，故事聚焦于主人公古海，他为了营救被太阳神宫掳走的小柔，决定韬光养晦，准备积攒人力和财力，为未来的战斗做好充分的准备。

大乾王朝与太阳神宫之间的紧张局势愈发升温，全面战争即将爆发。在这个危急时刻，古海必须做出重要的抉择。他面临着对个人、对家人、对国家的责任。为了拯救小柔，他决定选择韬光养晦，将战斗的精力聚焦于准备中，以确保最终的胜利。

然而，在准备的过程中，古海却遭遇了一系列意想不到的挑战。他与大乾王朝神机营统帅李浩然产生冲突，被贬为斥候，被派往恶人谷调查案件。在调查的过程中，古海意外揭示了一个惊天秘密：太阳神宫竟在恶人谷内利用恶人制造新式武器，这对于整个战局产生了巨大的影响。